من أعظم علماء الفلك العرب في عهد الدولة الفاطمية. ظهر خلال عهد الدولة الفاطمية، وبرع في علوم الفلك، وقد ساعدته أجهزة مرصد القاهرة في أيام الفاطمين على حساب ووضع جداول فلكية جديدة، من أدق ما عرف حتى ذلك التاريخ، فأدت أرصاده إلى تحسين قيم الثوابت الفلكية.
قام ابن يونس المصري بحل كثير من مسائل الفلك الكروي بالإسقاط المتعامد، ثم تولى تاسيس مرصد ابن يونس الفلكي وكانت جزءا من دار الحكمة التي أسسها الفاطميون بالقاهرة، وقد استمرت قائمة منذ عام 1005 إلي نهاية عهد الفاطمين عام 1711، وتعتبر ثاني أكاديمية علمية بعد بيت الحكمة ببغداد